Le logiciel bibliographique commercial EndNote (à partir de la version X4) propose le type de référence Data Set avec les champs spécifiques suivants : Investigators (équivalent du champ Author des publications), Producer, Distributor, Study Number, Original Release Date, Series Title, Version, Date of Collection, Version History, Geographic Coverage, Time Period, Unit of Observation, Data Type, Dataset(s). Les références de jeux de données peuvent être exportées et insérées dans un article selon le format de la revue.

Le logiciel libre Zotero (version 5.0.95.1) n’a pas de type de référence pour décrire les jeux de données. Les références de jeux de données importées dans une bibliothèque Zotero apparaissent sous le type Document.

Le logiciel gratuit Mendeley Reference Manager (version en ligne 2.43.0) n’a pas de type de document spécifique pour gérer les références de jeux de données.